Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms