Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc174Q3U155 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc174Q3U155 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms