Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp39Q3TIX9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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