Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f1Q3THK3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms