Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms