Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms