Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms