Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms