Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NfiaQ02780 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NfiaQ02780 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NfiaQ02780 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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