Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms