Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cacna1cQ01815 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms