Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cited1P97769 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms