Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NyxP83503 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NyxP83503 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NyxP83503 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms