Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms