Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcmtd1P59913 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms