Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpa1P57784 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms