Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmoP56726 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SmoP56726 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SmoP56726 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SmoP56726 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SmoP56726 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmoP56726 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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