Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CartptP56388 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CartptP56388 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CartptP56388 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms