Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms