Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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