Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf1P39428 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms