Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gjb1P28230 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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