Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2afxP27661 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2afxP27661 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms