Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb2P27090 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb2P27090 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms