Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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