Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pde6bP23440 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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