Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
DmdP11531 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
DmdP11531 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
DmdP11531 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
DmdP11531 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
DmdP11531 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
DmdP11531 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
DmdP11531 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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DmdP11531 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms