Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
P10404 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P10404 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P10404 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms