Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms