Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Myod1P10085 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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