Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Becn2P0DM65 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Becn2P0DM65 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms