Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1bP0C7A0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms