Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Me1P06801 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Me1P06801 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Me1P06801 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms