Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms