Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptpn9O35239 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptpn9O35239 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptpn9O35239 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptpn9O35239 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ptpn9O35239 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptpn9O35239 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptpn9O35239 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ptpn9O35239 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptpn9O35239 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptpn9O35239 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptpn9O35239 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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