Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ArxO35085 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArxO35085 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms