Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-Q1O19441 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Q1O19441 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-Q1O19441 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms