Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gcm2O09102 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gcm2O09102 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gcm2O09102 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gcm2O09102 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gcm2O09102 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcm2O09102 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gcm2O09102 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms