Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm20795J3QP49 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm20795J3QP49 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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