Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms