Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Vmn1r167G3UW71 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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