Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms