Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms