Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ddx60E9PZQ1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ddx60E9PZQ1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ddx60E9PZQ1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ddx60E9PZQ1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ddx60E9PZQ1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ddx60E9PZQ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ddx60E9PZQ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx60E9PZQ1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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