Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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