Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms