Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc5Q9QX29 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms