Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trem1Q9JKE2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trem1Q9JKE2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms