Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Scube2Q9JJS0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scube2Q9JJS0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms