Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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